O mini-curso tem como objetivo apresentar noções básicas de sequenciamento de DNA e genômica. Do histórico do sequenciamento, incluindo a evolução das técnicas até análises genômicas com exemplos de vários softwares.
NGS
A nova era no Sequenciamento de DNA e Análise de Dados
Topicos que serão abordados:
– Histórico de sequenciamento de DNA,
– Montagem e Anotação de genomas,
– Plataformas NGS,
– Análise de dados NGS,
– Análise de dados NGS,
– Análise de pan-genoma,
– Filogenômica,
– Análise de polimorfismo de nucleotídeo único,
– Análise de sintenia.
Aplicações no mercado de trabalho:
– Conhecer o DNA de organismos é importante para:
– Avaliar a relação evolutiva entre as espécies,
– Contribuir para estudos de medicina personalizada,
– Avaliar variabilidade genética entre as espécies,
Professora: Ana Carolina Barbosa Caetano,
Titulação: Biomédica e mestre em bioinformática
Biomédica pelo Centro Universitário de Belo Horizonte. Mestre em bioinformática pela Universidade Federal de Minas Gerais. Possui experiência em montagem e anotação de genomas, bem como análises de genômica comparativa. Soma- se a isso, experiência em métodos de PCR, cultura de células e imunofluorescência indireta para fins diagnóstico.
Publico alvo: alunos de biomedicina, biologia, biotecnologia e demais profissionais interessados.
Currículo do Curso
| Introdução | |||
| Introdução e Sequenciamento de Sanger | 00:00:00 | ||
| Plataforma 454 Roche | 00:00:00 | ||
| Solid | 00:00:00 | ||
| Ion Torrent | 00:00:00 | ||
| Illumina | 00:00:00 | ||
| Sequenciamento de Terceira Geração | |||
| Pacbio | 00:00:00 | ||
| Nanopore | 00:00:00 | ||
| Comparação Entre as plataformas | |||
| Comparação entre as Plataformas | 00:00:00 | ||
| Qualidade do Sequenciamento | |||
| Qualidade do Sequenciamento | 00:00:00 | ||
| Custo do Sequenciamento | 00:00:00 | ||
| Montagem do Genoma | |||
| Montagem do Genoma | 00:00:00 | ||
| Estratégias de Montagens | 00:00:00 | ||
| Tipos de Montagens | 00:00:00 | ||
| Cobertura | 00:00:00 | ||
| Como Avaliar uma Montagem? | 00:00:00 | ||
| Anotação de Genomas | 00:00:00 | ||
| Genômica e Aplicações | 00:00:00 | ||
| Análise de Pan-Genoma | 00:00:00 | ||
| Softwares para Análises de Pan-Genoma | 00:00:00 | ||
| Aplicações das Análises de Pan-genoma | 00:00:00 | ||
| Filogenômica | |||
| Filogenômica | 00:00:00 | ||
| Programas para Construção de Árvores Filogenômicas | 00:00:00 | ||
| Aplicações da Filogenômica | 00:00:00 | ||
| Análise de Sistenia | |||
| Análise de Sistenia | 00:00:00 | ||
| SNP | |||
| SNP | 00:00:00 | ||
| Software de Análise de Variantes | 00:00:00 | ||
| Sugestões de Livros e Artigos | |||
| Livros e Artigos | 00:00:00 | ||
| Questões | |||
| Questionário Final | 01:00:00 | ||
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